根据对特定蛋白质的氨基酸序列和DNA序列的比较，一般认为人群从与黑猩猩共同的祖先物种群中稳定分离出来的事件，发生在距今600万～800万年前。
在随后的600万年时间里，那个物种种群可能是一分为二：一部分成为人科种系，一部分成为黑猩猩种系，而黑猩猩种系后来又分化出一支倭黑猩猩。

对于已经灭绝的物种，只能通过化石记录来获得了解。正是化石记录告诉我们，人科种系在600万年里的演化，同样出现了一些分支，但唯独最终演化为目前之人类的这一支存活了下来，其他均已灭绝。

不过，上述图景只是一个理论的假设，相对最强的证据也只是来自分子生物学。最直接的化石记录证据方面还存在大量空白：

• 600万年前人科与黑猩猩共同祖先物种的化石记录迄今未发现；
• 黑猩猩那个分支更早的化石记录也未发现。

迄今所发现的人科种系这一系的化石记录，远未构成连续的序列，大体上只是给出了一个迁移的图景：200万年以前的人科物种化石从未在非洲之外的地区发现，合理的解释是，人科物种在200万年之前，只局限于非洲大陆，距今200万年之后，才从非洲散布到其他地区。

面对这样一个大体的图景，我们最关切的是，人类唯一有别于其他人科种群的部分-大脑，或者说高级神经系统的演化局面，是怎样一个进程。

化石研究的问题

人科物种化石个体一般都非常残破，例如，部分下颚骨，头顶颅骨，部分肢骨，在这种情势下，一般的思路，倾向于镶嵌式进化，就是形态分块式演化。然后以这种形态的分块来作为比较的单位，与现有的人类标准形态做比较。比较的一般方式，是定义距离指数。
问题是，

• 这种对形态进行分块的依据并不强；
• 镶嵌式进化也是缺乏发育生物学依据的设定；
• 距离指数能否反映进化机制？